独習Pythonバイオ情報解析

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改訂 独習Pythonバイオ情報解析

生成AI時代に活きるJupyter、NumPy、pandas、Matplotlib、Scanpyの基礎を身につけ、シングルセル、RNA-Seqデータ解析を自分の手で

編著者:先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム/編
発行日:2025年01月24日|AB判|446ページ|付録:ダウンロードデータ|ISBN 978-4-7581-2278-8

概要

Pythonの定番テキストが待望の改訂!大規模データの取り扱いや図による可視化など汎用的なPythonの使い方から、シングルセル,RNA-seq解析までバイオインフォマティクスの基礎が身につきます。サンプルデータとコード見本付きで、今日から実践しながら学べます。改訂では,生成AIの活用方法やScanpyの詳細な解説を加筆し,各種ライブラリのアップデートに対応しました。

改訂 独習Pythonバイオ情報解析

生成AI時代に活きるJupyter、NumPy、pandas、Matplotlib、Scanpyの基礎を身につけ、シングルセル、RNA-Seqデータ解析を自分の手で

改訂 独習Pythonバイオ情報解析 書影

編著者:先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム/編
発行日:2025年01月24日|AB判|446ページ|付録:ダウンロードデータ|ISBN 978-4-7581-2278-8

目次(抜粋)

  • 第1章:この本の使い方と事前準備【森 宙史】
  • 第2章:生成AIを用いたプログラミング【東 光一】
  • 第3章:Jupyter Notebookの使い方【谷澤 靖洋】
  • 第4章:Python速習コース【新海 典夫】
  • 第5章:文字列処理と正規表現【高橋 弘喜】
  • 第6章:Biopythonと塩基配列データ処理【谷澤 靖洋】
  • 第7章:pandasで表形式データ処理【坂本 美佳】
  • 第8章:RNA-Seqカウントデータ処理【坂本 美佳】
  • 第9章:Matplotlib・Seabornでの可視化【孫 建強】
  • 第10章:統計的仮説検定とモデル選択【森 宙史】
  • 第11~13章:シングルセル解析(前処理・次元削減・クラスタリング)【東 光一】
  • 付録A:NumPy入門【東 光一】
  • 付録B:Scanpyによるシングルセル解析【東 光一】

…そのほか、索引・執筆者一覧などを含む全13章+2付録構成

関連キーワード

  • Python
  • バイオインフォマティクス
  • 生成AI
  • シングルセル解析
  • RNA-Seq
  • Jupyter
  • Scanpy
  • pandas
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