実験医学別冊 型で実践する生物画像解析 ImageJ・Python・napari

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実験医学別冊 型で実践する生物画像解析 ImageJ・Python・napari

画像解析スキルをさらに高めたい方に! あなたの研究目的にあった画像解析法をデザインするための基本戦略とツールの種類・使い方を「型」で体得する超・実践型教本.コーディング未経験でも,最先端の機械学習・深層学習ツールを取り入れた解析自動化や,バイアスの少ない解析を実現できる力が身に付く.

実験医学別冊 型で実践する生物画像解析 ImageJ・Python・napari 書影

編者:三浦耕太,塚田祐基/編

発行日:2025年03月24日|AB判|351ページ|価格:6,930円(本体6,300円+税)|ISBN 978-4-7581-2280-1

目次(概略)

  • ◆基礎編:序論 ―生物画像解析の枠組みを理解する/Jythonの基礎知識と書き方/napariの基礎知識と書き方/Google Colaboratoryの利用法 ―クラウドPythonプログラミング
  • ◆実践編:核膜に移行するタンパク質の動態の測定/電子顕微鏡画像のミトコンドリア分節化と形状のクラスタリング解析/腫瘍血管における3次元管状構造ネットワークの分析/細胞移動を定量するための粒子追跡(トラッキング)/細胞周期の蛍光プローブFucciの時系列データ解析/甲殻類モデル生物Parhyale hawaiensisの脚再生過程の細胞動態解析/イネのデジタルカメラ画像によるバイオマス推定
  • ◆論文投稿編:画像解析の再現性チェックリストとGitHubの活用/画像データリポジトリとデータベース ―そのしくみと活用法
  • ◆発展編:Micro-Managerによる顕微鏡制御/イメージングデータの次世代ファイルフォーマット/生物画像解析の専門家ネットワークとGloBIAS
  • ◆付録:分節化のための機械学習ツールのリスト/英日対訳表

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